Система "ИНПРОЕКТ: пищевое производство" в первую очередь ориентирована на управленческий учет, но при этом имеет собственную подсистему бухгалтерского учета, включающую такие модули как "Касса", "Банк", "Основные фонды", "Сводный синтетический учет", "Зарплата и кадры" и другие. Также комплекс имеет средства интеграции с другими системами, что позволяет пользователю работать в привычных для него бухгалтерских системах.